Ответ на вопрос:
После того, как документ подписан электронной подписью, в файл нельзя вносить какие-либо изменения. В случае внесения исправлений после подписания, подписанный ранее электронной подписью документ становится недействительным. Поэтому, нет разницы в каком формате подписывается договор.
Рекомендуем ознакомиться
Какие требования есть к СЭД для установки полноценной взаимосвязанной системы СЭД-электронный архив?
Можно ли выпустить в сервисе 1С:Подпись сертификат для физического лица?
Можно ли выставить электронную счет-фактуру задним числом?
В каком виде должно быть соглашение об ЭДО?
Изменение правил делопроизводства в госорганах и органах местного самоуправления